दिमाग फैक्ट्री से इस बात के खाके के साथ आता है कि आपका शरीर कैसा दिखना चाहिए। और कभी-कभी वह खाका उस शारीरिक संरचना से मेल नहीं खाता जिसके साथ आप जन्मे थे।
2008 में, कैलिफोर्निया विश्वविद्यालय, सैन डिएगो के न्यूरोसाइंटिस्ट V.S. Ramachandran ने 29 ट्रांस पुरुषों का अध्ययन किया। उनमें से 60%, यानी 18 लोगों ने, एक ऐसे फैंटम लिंग को महसूस करने की बात बताई, जो जैविक रूप से उनके शरीर में कभी था ही नहीं। उन्हें उसका आकार, उसकी आकृति, और यहां तक कि इरेक्शन और ऑर्गैज़्म भी महसूस होते थे, जैसे वे किसी गैर-मौजूद अंग में स्थानीयकृत हों।
यह उस फैंटम अंग से अलग है जिसे लोग किसी अंग को काटकर हटा दिए जाने के बाद महसूस करते हैं। उस स्थिति में, मस्तिष्क ऐसी चीज़ को याद करता है जो वास्तव में मौजूद थी। इसके विपरीत, ट्रांस पुरुषों में मस्तिष्क ऐसी चीज़ का दावा कर रहा है जो उसके अपने न्यूरोलॉजिकल मानचित्र के अनुसार हमेशा से वहां होनी चाहिए थी। कई लोगों के लिए, यह उनकी पहचान की एक मूक पुष्टि होती है। दूसरों के लिए, इस अनुभूति और उनके वास्तविक शरीर के बीच का अंतर डिस्फोरिया का एक और स्रोत बन जाता है।
