Messi tidak sentiasa menang dengan bola. Yayasan beliau menyumbangkan 2,6 juta euro yang diperlukan untuk melengkapkan pembiayaan sebuah pusat yang menyokong kanak-kanak yang menghidap kanser, di Hospital Sant Joan de Déu.
Bersama-sama dengan Yayasan Stavros Niarchos, beliau menyiapkan projek yang menelan kos hampir 30 juta euro dan kini beroperasi sebagai salah satu pusat kanser kanak-kanak paling maju di dunia.
Bangunan itu mempunyai keluasan lebih daripada 5.100 meter persegi dan menghimpunkan diagnosis, rawatan, penyelidikan serta sokongan keluarga di bawah satu bumbung.
Sejak membuka pintunya, pusat itu telah merawat sekitar 400 kanak-kanak setiap tahun. Messi meletakkan nama dan wangnya di tempat yang paling diperlukan: untuk kesihatan mereka yang paling tidak mampu menunggu.