สมองมาจากโรงงานพร้อมพิมพ์เขียวว่าร่างกายของคุณควรมีลักษณะอย่างไร และบางครั้งพิมพ์เขียวนั้นก็ไม่ตรงกับกายวิภาคที่คุณเกิดมา
ในปี 2008 นักประสาทวิทยา V.S. Ramachandran แห่งมหาวิทยาลัยแคลิฟอร์เนีย ซานดิเอโก ศึกษาชายข้ามเพศ 29 คน 60% ของพวกเขา หรือ 18 คน รายงานว่ารู้สึกถึงอวัยวะเพศชายหลอนที่พวกเขาไม่เคยมีอยู่จริงทางชีววิทยา พวกเขารับรู้ได้ถึงขนาด รูปร่าง รวมถึงการแข็งตัวและการถึงจุดสุดยอดที่เกิดขึ้นในอวัยวะซึ่งไม่มีอยู่จริง
สิ่งนี้แตกต่างจากอวัยวะหลอนที่ผู้สูญเสียแขนขาจากการตัดออกยังคงรู้สึกได้ ในกรณีนั้น สมองกำลังคิดถึงบางสิ่งที่เคยมีอยู่จริง แต่สำหรับชายข้ามเพศ สมองกลับกำลังยืนยันว่ามีบางสิ่งที่ตามแผนที่ทางระบบประสาทของมันควรมีอยู่ตั้งแต่แรก สำหรับหลายคน สิ่งนี้คือการยืนยันตัวตนของพวกเขาอย่างเงียบ ๆ สำหรับคนอื่น ๆ ความแตกต่างระหว่างความรู้สึกนั้นกับร่างกายจริงกลับกลายเป็นแหล่งที่มาของความทุกข์ใจจากความไม่สอดคล้องทางเพศอีกประการหนึ่ง
