Ipinapanganak ang utak na may blueprint kung ano dapat ang hitsura ng iyong katawan. At kung minsan, hindi tumutugma ang blueprint na iyon sa anatomiya na taglay mo mula pagkasilang.
Noong 2008, pinag-aralan ng neuroscientist na si V.S. Ramachandran ng University of California, San Diego ang 29 na trans na lalaki. 60% sa kanila, o 18 katao, ang nag-ulat na nakadama sila ng phantom penis na hindi nila kailanman nagkaroon ayon sa biyolohiya. Nadama nila ang laki nito, ang hugis nito, at maging ang mga pagtayo at orgasmo na tila nakapokus sa isang organong wala naman.

Iba ito sa phantom limb na nararamdaman ng mga taong nawalan ng bahagi ng katawan dahil sa pagputol nito. Sa ganitong kaso, hinahanap ng utak ang isang bagay na dating naroon. Sa mga trans na lalaki, sa kabilang banda, iginigiit ng utak ang pagkakaroon ng isang bagay na, ayon sa sarili nitong neurological map, ay dapat laging naroon. Para sa marami, isa itong tahimik na pagpapatibay ng kanilang identidad. Para sa iba, ang pagkakaiba sa pagitan ng sensasyong iyon at ng kanilang aktuwal na katawan ay nagiging isa pang pinagmumulan ng dysphoria.

