大腦出廠時，就帶著一份身體應有模樣的藍圖。而有時候，那份藍圖與你出生時的身體構造並不相符。
2008年，加州大學聖地牙哥分校的神經科學家 V.S. Ramachandran 研究了29名跨性別男性。其中60%，也就是18人，表示感覺到一個自己生理上從未擁有過的幻肢陰莖。他們能感知到它的大小、形狀，甚至感受到勃起與高潮發生在一個不存在的器官中。
這與人們因截肢失去肢體後所感受到的幻肢不同。在那種情況下，大腦想念的是某個確實存在過的事物。相較之下，對跨性別男性而言，大腦所宣告的是某個根據自身神經學地圖本應一直存在的東西。對許多人而言，這是對其身分的無聲確認。對另一些人來說，這種感覺與實際身體之間的落差，則成為性別焦慮的另一個來源。
